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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
26/12/2019 |
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Data da última atualização: |
13/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BLECHA, I. M. Z.; SOUSA, I. I.; FERREIRA, A. B. R.; FEIJO, G. L. D.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SIQUEIRA, F. |
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Afiliação: |
Isabella Maiumi Zaidan Blecha, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul - UFMS/Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Programa de Pós-Graduação em Ciência Animal; Isadora Inácio Sousa, Universidade Federal de Mato Grosso do Sul - UFMS/Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia. Programa de Pós-Graduação em Ciência Animal; ANNA BEATRIZ ROBOTTOM FERREIRA, CTAA; GELSON LUIS DIAS FEIJO, CNPGC; ROBERTO AUGUSTO DE A TORRES JUNIOR, CNPGC; FABIANE SIQUEIRA, CNPGC. |
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Título: |
Alternative methodologies for genotyping polymorphisms in the CAST and CAPN1 genes in beef cattle. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Zootecnia, v. 48, e20180218, 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The objectives of this study were to genotype single nucleotide polymorphisms (SNP) AF159246:g.2959A>G (CAST/DdeI) and AF248054.2:g.6545C>T (CAPN4751) in beef cattle by PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism), using the restriction enzyme DdeI for both SNP, and describe the use of these genotyping methodologies for the first time. For the SNP located in the CAST gene, new primers were designed, and for the SNP of the CAPN1 gene, the same primers previously described in the literature were used. Bonsmara, Caracu, Senepol, Nelore, and Angus bulls were chosen from among the most used bulls in breeding programs according to their genealogy and the lowest possible degree of parentage between them to ensure an experimental sample representative of the genetic variability in each breed. For the CAST and CAPN1 genes, respectively, the following number of animals were analyzed: Bonsmara (n = 25/22), Caracu (n = 25/26), Senepol (n = 25/24), Nelore (n = 26/26), and Angus (n = 25/24). The accuracy of these methodologies was confirmed by direct sequencing of PCR products generated for the two polymorphisms. The new primers developed for CAST/DdeI SNP detection and the use of DdeI enzyme for CAPN4751 SNP detection were effective in genotyping, since no inconclusive genotypes were observed for these genes. Thus, the genotyping of beef cattle using the PCR-RFLP technique for CAST and CAPN1 genes is robust, relatively inexpensive, and easy to perform in any basic molecular biology laboratory. If the association of these markers with traits of economic interest in beef cattle is confirmed in new studies, these methodologies may contribute to the selection of animals with superior genetics, i.e., with the potential to produce better-quality meat, either by marker-assisted selection or by the inclusion of these polymorphisms in high-density marker panels. MenosThe objectives of this study were to genotype single nucleotide polymorphisms (SNP) AF159246:g.2959A>G (CAST/DdeI) and AF248054.2:g.6545C>T (CAPN4751) in beef cattle by PCR-RFLP (Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism), using the restriction enzyme DdeI for both SNP, and describe the use of these genotyping methodologies for the first time. For the SNP located in the CAST gene, new primers were designed, and for the SNP of the CAPN1 gene, the same primers previously described in the literature were used. Bonsmara, Caracu, Senepol, Nelore, and Angus bulls were chosen from among the most used bulls in breeding programs according to their genealogy and the lowest possible degree of parentage between them to ensure an experimental sample representative of the genetic variability in each breed. For the CAST and CAPN1 genes, respectively, the following number of animals were analyzed: Bonsmara (n = 25/22), Caracu (n = 25/26), Senepol (n = 25/24), Nelore (n = 26/26), and Angus (n = 25/24). The accuracy of these methodologies was confirmed by direct sequencing of PCR products generated for the two polymorphisms. The new primers developed for CAST/DdeI SNP detection and the use of DdeI enzyme for CAPN4751 SNP detection were effective in genotyping, since no inconclusive genotypes were observed for these genes. Thus, the genotyping of beef cattle using the PCR-RFLP technique for CAST and CAPN1 genes is robust, relatively inexpensive, and easy to perform i... Mostrar Tudo |
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Thesaurus Nal: |
Animal breeding; Marker-assisted selection; Meat tenderness. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/207815/1/Alternative-methodologies-for-genotyping.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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| Registros recuperados : 33 | |
| 2. |  | SUNIGA, P. A. P.; FERREIRA, A. B. R.; JULIANO, R. S.; EGITO, A. A. do. Genotipagem e prospecção de SNPs no gene HSF1, relacionado à termotolerância em bovinos. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 10., 2014, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2014. p. 84-85. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 208). Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 3. | | URQUIZA, A. da S. C.; SIQUEIRA, F.; MENEZES, G. R. de O.; FERREIRA, A. B. R.; FERRAZ, A. L. J. Análise comparativa de métodos de genotipagem para avaliação da Síndrome da Musculatura Dupla em bovinos de corte. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 13., 2017, Campo Grande, MS. [Anais...] Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 22-23.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 4. | | DAURIA, B. D.; FERRAZ, A. L. J.; EGITO, A. A. do; FERREIRA, A. B. R.; FEIJO, G. L. D. Caracterização genética de raças zebuínas e taurinas e sua aplicação na determinação da composição racial de animais cruzados. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 11., 2015, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2015. 114 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 213). 2 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 5. | | OLIVEIRA, F. S.; FERREIRA, A. B. R.; JULIANO, R. S.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; EGITO, A. A. do. Variabilidade do loco BoLA DRB3.2 em raças bovinas localmente adaptadas. In: SIMPOSIO IBEROAMERICANO SOBRE CONSERVACIÓN Y UTILIZACIÓN DE RECURSOS ZOOGENÉTICOS, 16., 2015, Villavicencio, Colombia. Iberoamérica compartirá experiencias y logros científicos: libro de resúmenes... Villavicencio, Colombia: Asocriollanos: Red Conbiand Co-lombia: Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira, 2015. p. 82| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 6. | | NASCIMENTO, M. E. M.; MAZETO, C. M.; FERREIRA, A. B. R.; SOUSA, I. I.; MARTINI, E. A.; EGITO, A. A. do; FEIJO, G. L. D.; SIQUEIRA, F. Banco de DNA para prospecção e validação de marcadores moleculares associados a características de interesse econômico em bovinos de corte. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 14., 2018, Campo Grande - MS. [Resumos dos trabalhos]. Brasília, DF, Embrapa, 2018 115 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 258). p. 74-75| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos; Embrapa Gado de Corte. |
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| 7. | | SOUSA, I. I.; SIQUEIRA, F.; FERREIRA, A. B. R.; SANTIAGO, G. G.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SOUZA JUNIOR, M. D.; FARIA, F. J. C. Análise funcional de genes associados com espessura de gordura subcutânea em bovinos Canchim. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 13., 2017, Campo Grande, MS. [Anais...] Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 42-43.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 10. | | BLECHA, I. M. Z.; SIQUEIRA, F.; FERREIRA, A. B. R.; FEIJO, G. L. D.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SANTIAGO, G. G.; FERRAZ, A. L. J. Prospecção e validação de polimorfismos de nucleotídeo único nos genes bovinos FABP3 e FABP4 In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 9., 2013, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2013. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 204). Comissão organizadora: Denise Baptaglin Montagner, Grácia Maria Soares Rosinha, Rodrigo Carvalho Alva.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 11. | | XAVIER, S. R.; SIQUEIRA, F.; BLECHA, I. M. Z.; FERREIRA, A. B. R.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SANTIAGO, G. G.; FERRAZ FILHO, P. B. Polimorfismos de nucleotídeos únicos no gene da miostatina em bovinos da raça Senepol. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 9., 2013, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2013. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 204). Comissão organizadora: Denise Baptaglin Montagner, Grácia Maria Soares Rosinha, Rodrigo Carvalho Alva| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 12. | | BLECHA, I. M. Z.; SIQUEIRA, F.; FERREIRA, A. B. R.; FEIJO, G. L. D.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MEDEIROS, S. R. de. Identification and evaluation of polymorphisms in FABP3 and FABP4 in beef cattle. Genetics and Molecular Research, v.14, n. 4, p. 16353-16363, 2015| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 13. | | SOUSA, I. I.; BLECHA, I. M. Z.; MACIEL, S. da S.; FERREIRA, A. B. R.; FEIJO, G. L. D.; FAVERO, R.; SANTIAGO, G. G.; SIQUEIRA, F. Estudo de associação de polimorfismos nos genes LEP e TG com características de qualidade de carne e carcaça em bovinos da raça Canchim. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 27.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNISTAS, 45.; FÓRUM DE COORDENADORES DE CURSOS DE ZOOTENCIA, 12.; SEMINÁRIO NACIONAL DE ENSINO EM ZOOTECNIA, 7.; REUNIÃO NACIONAL DE SINDICATO DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE EMPRESAS JUNIORES DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE ESTUDANTES DE ZOOTECNIA, 13, 2017, Santos. Santos: Associação Brasileira de Zootecnia, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 14. | | BLECHA, E. M. Z.; SIQUEIRA, F.; CARDOSO, F. F.; CSORDAS, B. G.; AGUIRRE, A. A. R.; FERREIRA, A. B. R.; BARROS, J. C.; ANDREOTTI, R. Genômica funcional para identificação de genes associados à resistência ao carrapato em bovinos de diferentes grupos genéticos. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 13., 2017, Campo Grande, MS. [Anais...] Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 40-41.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 15. | | SOUSA, I. I.; BLECHA, I. M. Z.; MACIEL, S. da S.; FERREIRA, A. B. R.; FEIJO, G. L. D.; SANTIAGO, G. G.; FAVERO, R.; SIQUEIRA, F. Genotipagem por PCR-RFLP de um polimorfismo no gene CAST em bovinos da raça Canchim. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 27.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNISTAS, 45.; FÓRUM DE COORDENADORES DE CURSOS DE ZOOTENCIA, 12.; SEMINÁRIO NACIONAL DE ENSINO EM ZOOTECNIA, 7.; REUNIÃO NACIONAL DE SINDICATO DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE EMPRESAS JUNIORES DE ZOOTECNIA, 5.; FÓRUM DE ESTUDANTES DE ZOOTECNIA, 13, 2017, Santos. Santos: Associação Brasileira de Zootecnia, 2017.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 16. | | OLIVEIRA, F. S.; LIMA, T. P. C.; FERREIRA, A. B. R.; JULIANO, R. S.; FIORAVANTI, M. C. S.; ALBUQUERQUE, M. do S. M.; EGITO, A. A. do. Variabilidade do loco BoLA DRB3.2 em raças bovinas localmente adaptadas. In: SIMPOSIO IBEROAMERICANO SOBRE CONSERVACIÓN Y UTILIZACIÓN DE RECURSOS ZOOGENÉTICOS, 16., 2015, Villavicencio, Colombia. Iberoamérica compartirá experiencias y logros científicos: libro de resúmenes. Villavicencio, Colombia: Asocriollanos: Red Conbiand Colombia: Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira, 2015. p. 82.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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| 17. | | OLIVEIRA, F. S.; LIMA, T. P. C.; FERRAZ, A. L. J.; FERREIRA, A. B. R.; SUNIGA, P. A. P.; JULIANO, R. S.; EGITO, A. A. do. Sequenciamento e diversidade do gene drb3.2 do complexo principal de histocompatibilidade (mhc) de bovinos. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 10., 2014, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2014. p. 40-41. 2 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 208). Comissão organizadora: Grácia Maria Soares Rosinha, Alexandra Rocha de Oliveir, Rodrigo Carvalho Alva.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 18. | | BLECHA, I. M. Z.; SOUSA, I. I.; BENITES, J. T. R.; FERREIRA, A. B. R.; SANTIAGO, G. G.; FEIJO, G. L. D.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MEDEIROS, S. R. de; FERRAZ, A. L. J.; SIQUEIRA, F. Association of the FABP3/Pvu I polymorfism with carcass and meat quality traits in beef cattle In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 60., 2014, Guarujá. Resumos. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 131.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 19. | | Santiago, GG; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MEDEIROS, S. R. de; FEIJO, G. L. D.; Souza Junior, MD; Blecha, I. M. Z.; Souza, I. I; FERREIRA, A. B. R.; SIQUEIRA, F. Association of a snp in the lhx4 gene with production traits in beef cattle. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 60., 2014, Guarujá. Resumos. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 67.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 20. | | SOUZA, I. I.; BLECHA, I. M. Z.; FERREIRA, A. B. R.; FEIJO, G. L. D.; SANTIAGO, G. G.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SOUZA JUNIOR, M. D.; SIQUEIRA, F. Associação de um polimorfismo no gene FABP3 com características de produtividade em bovinos da raça Canchim. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 11., 2015, Campo Grande, MS. Anais... Campo Grande: Embrapa Gado de Corte, 2015. 114 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 213).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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